奇方类编序卷上头面门清空膏都良丸头疼奇方又治头疼偏头疼方治年老人气血虚头疼方治头上白秃治秃头川芎茶调散薄荷八两半夏白术天麻汤治抓破面上皮治两腮红肿治腮治下颏落方治久患头疼年久不愈者太阳疼头昏头痛须发门
卷上勿药须知疗心法言林鉴堂安心诗养心说养肝说养脾说养肺说养肾说斋说食忌说食饮以宜居室安处论居处宜忌说寝室宜忌说卧时祝法睡诀孙真人卫生歌真西山卫生歌养神气铭孙真人养生铭谨疾箴导引却病法内养下手诀运气法固
百家针灸歌赋
醉花窗医案
难经本义
武当淮河派丹丸膏散秘方
仁端录
题辞卷之一天道部天地阴阳大论其气三论六节五制生五论正六气说为运为气五六说五运说司天说地上三阴三阳说天道或问五则天道六气中见论地理六节位下六承论辨君火以明兼退行一步不司气化论卷之一人道部人道大阴阳疏心肾
序卷一脉形状指下秘决第一（二十四种）平脉早晏法第二分别三关境界脉候所主第三辨尺寸阴阳荣卫度数第四平脉视人大小长短男女逆顺法第五持脉轻重法第六两手六脉所主五脏六腑阴阳逆顺第七辨脏腑病脉阴阳大法第八辨脉阴
简介普济方有关说明卷一 方脉总论 辨男女形生神毓论卷二 方脉总论 辨奇经八脉法卷三 方脉总论 辨七表八里脉法卷四 方脉总论 九道病脉卷五 方脉药性总论 药性总论卷六 五运六气图卷七 运气图 甲子岁图卷